自 23 级起，跨专业发展课程学分从创新学分 14 分中独立出来，本科生要求修读至少 10 学分跨专业课程，即在选课界面「跨专业课程体系」下的课程。跨专业课程主要有三类：
- 与主课程合班，此类课程的考核与主课程一致，要求较高。课程代码一般与主课程代码一致。
- 辅修课程特供，此类课程与主课程授课内容大体相近，但有单独的考核要求，一般比主课程低，比通识课程高。课程代码一般在主代码后加 F，如 ECON2005F 经济学原理。
- 通识性质课程，此类课程并非某个专业的专业课，而是单独设计的通识课程，课程代码一般是在主课程代码后加 C 或者单独设计代码，如 EE3027C 现代电机设计导论，SPST1004 普通天文学。
申请辅修的同学退出辅修后，辅修课程学分自动转为跨专业发展课程学分。而辅修选课在跨专业选课前完成，所以用辅修来保证一定能选上跨专业课程也是一种方法。
大类集群大一/大二的 n 选一课程或者轨道课程中，分流后已修读的非本专业课程自动转为跨专业课程学分。比如 23 级自动化与电气工程集群，大二下「电磁场」和「控制理论中的代数基础」二选一，则选择电气专业的同学若选修了「控制理论中的代数基础」，将自动转换为跨专业学分。
如果跨专业课程选修的课程在分流后为专业培养方案内的课程，则跨专业课程学分自动成为必修学分/限选学分，而不再作为跨专业学分，即使两门课程课程代码不完全一致。比如 22 级大数据学长出现过选修计算机跨专业课程 COMP3007 模式识别，从而无法选修本专业限选课程 COMP3054 模式识别的情况。
由于跨专业课程较多，放在一个仓库下不方便阅读，因此将跨专业课程分成了如下七个仓库：
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理学类跨专业课程：主要包括理学院开设的数学、物理学、化学、生物学和数据科学跨专业课程。
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电子信息类跨专业课程：主要包括智能科学与工程学院开设的自动化跨专业课程、计算机科学与技术学院开设的计算机跨专业课程、信息科学与技术学院开设的通信工程跨专业课程和集成电路学院开设的集成电路跨专业课程。
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空天科技类跨专业课程：主要包括空天科技学院开设的空间科学跨专业课程。
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能动电气类跨专业课程：主要包括机器人与先进制造学院开设的电气、动力和机械跨专业课程。
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土木环境类跨专业课程：主要包括智能土木与海洋工程学院开设的土木工程跨专业课程和生态环境学院开设的环境工程跨专业课程。
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经管类跨专业课程：主要包括经济管理学院开设的经济学和会计学跨专业课程。
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设计类跨专业课程：主要包括建筑学院开设的建筑学跨专业课程和未来设计学院开设的数字媒体艺术跨专业课程。