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O gerador de XML PMC está retirando todos os atributos da tag <abstract>, resultando em XMLs que não são aceitos dentro do Schema/DTD do PubMed Central.
Para que a geração de XML resulte em arquivos válidos contra o PMCTG (PubMed Central Tagging Guidelines), todos os atributos presentes no XML devem ser mantidos.
Segue, em anexo, pacote contendo XML original e XML gerado a partir da ferramenta com <abstract> + @abstract-type="key-points"